例の簡易インストーラーでインストールしてみた。

p2インストーラー(Equinox p2を使った場合のインストーラー)を使うとだいぶインストール後の様子が変わっていました。
インストール直後のフォルダ

.eclipseproduct
configuration
dropins
eclipse.exe
eclipse.ini
eclipsec.exe
epl-v10.html
notice.html
p2
readme

これまで使ってたfeaturesやらpluginsやらがなくなり、dropinsとp2が増えてますね。最初これだけしなかったので、ダウソロード失敗だと思ってましたよ。p2フォルダをまた潜ってみましょうかね。

 org.eclipse.equinox.p2.core
 org.eclipse.equinox.p2.director
 org.eclipse.equinox.p2.engine
 org.eclipse.equinox.p2.metadata.repository
 org.eclipse.equinox.p2.touchpoint.eclipse

はい。まだプラグインぽいものはありません。どこにあるかというと、この「org.eclipse.equinox.p2.touchpoint.eclipse」の中にどどんとプラグインが入っております。フィーチャーは今のところ見当たりません。M6リリースからフィーチャー構成管理が一新されてますが、ともするとフィーチャーという概念自体がなくなってるのかもしれません。たぶんそんなことはないと思うので、もうちょっと追いかけよう。